O acidente fatal ocorreu no dia 3 de julho de 2025, na região de Zamora, em Espanha, vitimando o jogador de 28 anos e o seu irmão de 25. A notícia chocou o mundo do desporto e a sociedade portuguesa, especialmente por ter acontecido apenas dez dias após o casamento do futebolista com Rute Cardoso, com quem tinha três filhos pequenos. A Guarda Civil espanhola, responsável pela investigação, descartou a teoria inicial de que o rebentamento de um pneu teria causado o despiste, avançando com outras linhas de inquérito para determinar as circunstâncias exatas da tragédia. Nas semanas que se seguiram, a dor da família foi partilhada publicamente, com a realização da missa do sétimo dia em Gondomar, que contou com a presença de familiares, amigos e colegas de profissão. A viúva, Rute Cardoso, tem enfrentado um período de grande luto, sendo o seu futuro e o dos filhos uma preocupação central. A onda de solidariedade manifestou-se de várias formas, incluindo a criação de dois murais de homenagem a Diogo Jota em Liverpool, cidade onde jogava. Em simultâneo, surgiram nas redes sociais rumores infundados, como a notícia falsa de que os músicos Rihanna e Asap Rocky iriam adotar o filho mais novo do jogador, que foram prontamente desmentidos.
